Ang isomerisasyon ay isang reaksyon ng kemikal, ang prinsipal na produkto na kung saan ay isomeriko na may pangunahing reaktante. Isang intramolekular na isomerisasyon na nagsasangkot ng paglabag o paggawa ng mga pagsasama ng isang espesyal na kaso ng isang molekular na pagbabago ng ayos.